Фи Брейн: Загадка Бога — Орден Орфея

События разворачиваются после поломки браслета Орфея, что привело к временному затишью в жизни главных героев. Однако не все персонажи смирились с судьбой ЗБ. На сцену выходит таинственная организация Орден Орфея, которая считает Даймона ренегатом и предателем. Члены организации начинают охоту на него, но попытки устранить юного гения оказываются безуспешными.

Враги вторгаются в школу Квадратного Корня, что вынуждает бывших противников Даймона объединиться с ним для защиты учебного заведения. Сюжет строится вокруг противостояния главного героя и Ордена Орфея, а также временного союза с прежними врагами. Развитие событий сосредоточено на конфликте между Даймоном и организацией, которая преследует свои цели, связанные с его прошлым.