Нэгима?! Весенний спецвыпуск?!

Действие разворачивается через некоторое время после событий, произошедших в течение первого года работы Неги в качестве учителя. Класс 2-A отправляется на весенние каникулы на живописный остров. Несмотря на то, что обстановка кажется спокойной, Неги продолжает оставаться в центре внимания учениц. Кроме того, у него возникает личная проблема: Асуна злится на него из-за того, что он заявил, будто её присутствие не связано с его обучением магии.

Во время поездки напряжение нарастает. Подруги Асуны пытаются помочь Неги помириться с ней. Исход этой ситуации зависит от того, сможет ли Неги найти правильный подход к Асуне и уладить конфликт, возникший между ними.