Детектив Конан: На перекрёстках древней столицы

В Японии происходит серия убийств: маскированный самурай убивает пятерых мужчин в Токио, Осаке и Киото. Полиция выясняет, что все жертвы были членами банды Гэндзиботару, специализировавшейся на краже буддийских статуй и артефактов. Участники банды использовали псевдонимы, основанные на именах слуг Минамото-но Ёсицунэ. Расследование заходит в тупик из-за отсутствия мотивов и улик для опознания других членов группы.

Монахи храма в Киото получают анонимное письмо с загадкой и обращаются за помощью к известному детективу Когоро Мори. Параллельно детектив Конан Эдогава и старшеклассник-детектив Хэйдзи Хаттори объединяются для решения головоломки и поиска убийцы. Хаттори также разыскивает свою возлюбленную из детства. Убийца продолжает действовать: он убивает очередного члена банды, совершает попытки покушения на Хаттори и похищает его подругу. Конан и Хаттори должны совместно восстановить скрытые улики, чтобы остановить убийцу и спасти похищенную.